Yeast HiPure Plasmid Maxi Kit
酵母高純度質粒大量快速提取試劑盒
目錄號:PE114
適用范圍:
適用于大規模高純度酵母質粒制備。
試劑盒組成、儲存、穩定性:
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試劑盒組成
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保存
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10次(PE114-01)
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RNaseA(10mg/ml)
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-20℃
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750μl
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破壁酶LE
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4℃
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1g(常溫運輸)
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溶液YA
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4℃
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75 ml
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溶液YB
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室溫
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75 ml
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溶液YC
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室溫
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110 ml
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去蛋白液PD
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室溫
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100 ml
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漂洗液WB
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室溫
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25 ml x 2
第一次使用前按說明加指定量乙醇
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洗脫緩沖液EB
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室溫
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20 ml
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吸附柱DC
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室溫
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10個
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收集管CT(50ml)
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室溫
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10個
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本試劑盒在室溫儲存12個月不影響使用效果。
儲存事項:
1、第一次使用時,將試劑盒所帶的全部RNase A加入溶液YA(終濃度100μg/ml)置于4℃保存。如果溶液YA中RNase A失活,提取的質粒可能會有微量RNA殘留,在溶液YA中補加RNase A即可。
2、環境溫度低時溶液YB中SDS可能會析出渾濁或者沉淀,可在37℃水浴加熱幾分鐘,即可恢復澄清,不要劇烈搖晃,以免形成過量的泡沫。
3、避免試劑長時間暴露于空氣中產生揮發、氧化、pH值變化,各溶液使用后應及時蓋緊蓋子。
產品介紹:
本試劑盒采用改進SDS-堿裂解法裂解細胞并結合破壁酶LE特異消化酵母細胞壁,能在1小時內從酵母培養液中分離出高純度質粒DNA。酵母收集后,加入破壁酶LE去除細胞壁后,然后堿裂法裂解細胞,離心吸附柱內的硅基質膜在高鹽、低PH值狀態下選擇性地結合溶液中的質粒DNA,再通過去蛋白液和漂洗液將雜質和其它細菌成分去除, 最后低鹽、高PH值的洗脫緩沖液將純凈質粒DNA從硅基質膜上洗脫。
產品特點:
1、離心吸附柱內硅基質膜全部采用世界著名公司特制吸附膜,柱與柱之間吸附量差異極小,可重復性好。
2、快速、方便,不需要使用有毒的苯酚、氯仿等試劑,也不需要乙醇沉淀。獲得的質粒產量高、純度好,可以直接用于酶切、轉化、PCR、體外轉錄、測序等各種分子生物學實驗。
注意事項
1、所有的離心步驟如未加另外說明均在室溫完成,使用轉速可以達到至少6,000xg,帶50ml轉頭的臺式離心機。
2、溶液YC和去蛋白液PD中含有刺激性化合物,操作時要戴乳膠手套,避免沾染皮膚、眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時,要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
3、通常酵母質粒拷貝數都很低,高拷貝質粒最大得率一般為每5 ml 培養物提取1μg左右的質粒。用于下游試驗時通常建議使用量為: 1-5μl用做PCR 模板;5-10μl 用于轉化大腸桿菌,選擇高效率的感受態細胞。
4、得到的質粒DNA可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。OD260值為1相當于大約50μg/ml DNA。電泳可能為單一條帶,也可能為2條或者多條DNA條帶,這主要是不同程度的超螺旋構象質粒泳動位置不一造成, 與提取物培養時間長短、提取時操作劇烈程度等有關。本公司產品正常操作情況下基本超螺旋可以超過90%。
5、用戶需要自備Sorbitol buffer( 1M 山梨醇, 0.1M Na2EDTA,14 mMβ-巰基乙醇)。配制方法:在600 ml 去離子水里面溶解 182.2克山梨醇,加入200 ml 0.5 M Na2EDTA (pH 8.0) ,不需要調節PH值,定容到1L,4℃保存。臨用前加0.1%β-巰基乙醇(商品化的β-巰基乙醇摩爾濃度一般為14M)。
6、菌體濃度檢測一般OD600值為1的時候,釀酒酵母細胞是1-2x107 cells/ml,由于菌種和分光度計不同即使同樣細胞數量OD值變化也很大,以上僅供參考。
7、洗脫液EB不含有螯合劑EDTA,不影響下游酶切、連接等反應。也可以使用水洗脫,但應該確保批pH大于7.5, pH過低影響洗脫效率。用水洗脫質粒應該保存在-20℃。質粒DNA如果需要長期保存,可以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影響下游酶切反應,使用時可以適當稀釋。
操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)
提示:
● 第一次使用前請先在漂洗液WB瓶中加入指定量無水乙醇,充分混勻,加入后請及時在方框打鉤標記已加入乙醇,以免多次加入!
● 將RNase A全部加入溶液YA中,混勻。每次使用后置于2-8℃保存。
● 將溶液YC放在冰上預冷。
● 吸取使用量的Sorbitol buffer加入0.1%β-巰基乙醇,回復到室溫備用。
1、取約100-180毫升酵母培養物,6000xg,離心10分鐘,盡可能的倒干上清,收集菌體。
收集超過50毫升菌液,可以離心棄上清后,在同一個50ml管內加入更多的菌液,重復步驟1,直到收集到足夠的菌體。
2、加入10ml Sorbitol buffer,輕柔吹打充分重懸細胞;加入0.1g 破壁酶LE(破壁酶LE臨用前用2ml Sorbitol buffer溶解),充分顛倒混勻,37℃溫育1-2小時消化細胞壁,中間可顛倒數次幫助消化。
如果破壁效果不好導致質粒產量過低,可以加大破壁酶LE用量來提高酶工作濃度,還可以延長消化時間或者提高溫度到45℃來提高效果,不適合破壁消化的酵母可選用Lyticase 或者Zymolase或者其它方法如加玻璃珠渦旋振蕩,反復凍融等。
3、6000xg,離心10分鐘,盡可能吸棄上清,加入7ml溶液YA重懸菌體沉淀,渦旋振蕩至徹底懸浮。
如果有未徹底混勻的菌塊,會影響裂解,導致提取量和純度偏低。
4、加7ml的溶液YB,溫和地上下翻轉4 -7次使菌體充分裂解,室溫放置4分鐘。
溫和地混合,不要劇烈震蕩,以免基因組DNA剪切斷裂!所用時間不應超過5分鐘!以免質粒受到破壞。此時菌液應變得清亮粘稠,如果菌體少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要準確的5分鐘。如果未變得清亮,可能由于菌體過多,裂解不徹底,應減少菌體量。
5、加10ml溶液YC,立即溫和地上下翻轉4 -7次,充分混勻此時會出現白色絮狀沉淀。冰上靜置5-10分鐘,4℃ ,至少2500xg離心20分鐘(加大離心力可相應縮短離心時間,如15000xg離心10分鐘),小心取上清,避免吸取到漂浮的白色沉淀。
加入溶液YC后應該立即混勻,以免產生SDS的局部沉淀,如果上清中還有飄浮白色沉淀,可再次離心后取上清。
6、可選,一般不需要:4℃,2500xg 再次離心10 分鐘,小心取上清。
7、將上一步所得上清加入吸附柱DC中(吸附柱DC放入收集管CT中),靜置2分鐘,2500xg離心2分鐘,倒掉收集管CT中的廢液。
如果上清體積超過20ml,可以分多次過柱。
8、加入10ml去蛋白液PD,2500xg離心2分鐘,棄掉廢液。
9、加入10ml漂洗液WB(請先檢查是否已加入無水乙醇!),2500xg離心2分鐘,棄掉廢液。
10、重復操作步驟9一次。
11、將吸附柱DC放回空收集管CT中,最高速(最好大于9000xg,如果離心機轉速低,需要相應延長離心時間)離心10分鐘以干燥膜基質殘留乙醇,用槍頭吸除內圈壓環和柱壁之間可能殘留的乙醇,室溫或者烘箱晾干幾分鐘。
該步驟目的為徹底去除吸附柱中殘留乙醇,殘留乙醇抑制下游反應并且嚴重降低洗脫效率,降低質粒產量。如果洗脫產量低,則必須加做步驟12。
12、可選步驟: 選擇以下兩種方法之一干燥柱子:
① 取下柱子放置于真空容器中,密封真空容器,提供真空15分鐘;
② 將柱子放置于60-65℃真空干燥箱或烘箱中,放置10-15分鐘。
13、取出吸附柱DC,放入一個干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加1ml洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水浴中預熱效果更好),室溫放置2分鐘,6000 xg離心5分鐘。如果需要較多量質粒,可將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,離心2分鐘。
洗脫體積越大,洗脫效率越高,如果需要質粒濃度較高,可以適當減少洗脫體積, 但是最小體積不應少于0.6ml,體積過小降低質粒洗脫效率,減少質粒產量。