目錄號:PE106
適用范圍:
適用于5-15ml 中等規(guī)模質(zhì)粒制備(mind preparations)。
試劑盒組成、儲存、穩(wěn)定性:
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試劑盒組成
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保存
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50次(PE106-01)
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平衡液BS
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室溫
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5ml
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RNase A(10mg/ml)
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4℃
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250μl
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溶液A
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4℃
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25 ml
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溶液B
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室溫
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25 ml
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溶液C
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室溫
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25ml
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去蛋白液PS
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室溫
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16ml
第一次使用前按說明加指定量乙醇
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漂洗液WB
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室溫
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13ml
第一次使用前按說明加指定量乙醇
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洗脫緩沖液EB
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室溫
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15ml
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吸附柱AD
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室溫
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50個
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收集管CT(2ml)
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室溫
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50個
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本試劑盒在室溫儲存12個月不影響使用效果。
儲存事項:
1、Rnase A保存在即用型甘油緩沖液中,常溫運輸,收到后,不超過25℃室溫至少保存6個月,4℃保存12個月,長期保存放-20℃
2、第一次使用時,將試劑盒所帶的全部RNase A加入溶液A后(終濃度100ug/ml)置于2-8℃保存。如果溶液A中RNase A失活,提取的質(zhì)??赡軙形⒘縍NA殘留,在溶液A中補加RNase A即可。
3、環(huán)境溫度低時溶液B中SDS可能會析出渾濁或者沉淀,可在37℃水浴加熱幾分鐘,即可恢復澄清,不要劇烈搖晃,以免形成過量的泡沫。
4、避免試劑長時間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā)、氧化、pH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時蓋緊蓋子。
產(chǎn)品介紹:
本試劑盒采用改進SDS-堿裂解法裂解細胞,質(zhì)粒產(chǎn)量提高1-2倍,離心吸附柱內(nèi)的硅基質(zhì)膜在高鹽、低pH值狀態(tài)下選擇性地結(jié)合溶液中的質(zhì)粒DNA,再通過去蛋白液和漂洗液將雜質(zhì)和其它細菌成分去除,最后低鹽、高pH值的洗脫緩沖液將純凈質(zhì)粒DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。
產(chǎn)品特點:
1、特殊改進的高產(chǎn)量緩沖液配方可以把質(zhì)粒產(chǎn)量提高1-2倍。
2、獨有的去蛋白液配方,可以高效去除殘留的核酸酶,即使是核酸酶含量豐富的菌株如JM系列、HB101也可以輕松去除。有效防止了質(zhì)粒被核酸酶降解。
3、快速、方便,不需要使用有毒的苯酚、氯仿等試劑,也不需要乙醇沉淀。獲得的質(zhì)粒產(chǎn)量高、純度好, 可以直接用于酶切、轉(zhuǎn)化、PCR、體外轉(zhuǎn)錄、測序等各種分子生物學實驗。
注意事項
1、所有的離心步驟均在室溫完成,使用轉(zhuǎn)速可以達到13,000rpm的傳統(tǒng)臺式離心機。
2、提取質(zhì)粒的量與細菌培養(yǎng)濃度、質(zhì)??截悢?shù)等因素有關(guān)。一般高拷貝質(zhì)粒,建議取5-15 ml 過夜培養(yǎng)14-16個小時的菌液,可提取出多達40μg-90μg的純凈質(zhì)粒。如果所提質(zhì)粒為低拷貝質(zhì)粒或大于10kb的大質(zhì)粒,應(yīng)適當加大菌體使用量,同時按比例增加A、B、C的用量,其它步驟相同。
3、得到的質(zhì)粒DNA可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。OD260值為1相當于大約50μg/ml DNA。電泳可能為單一條帶,也可能為2條或者多條DNA條帶,這主要是不同程度的超螺旋構(gòu)象質(zhì)粒泳動位置不一造成,與提取物培養(yǎng)時間長短、提取時操作劇烈程度等有關(guān)。本公司產(chǎn)品正常操作情況下基本超螺旋可以超過90%。
4、質(zhì)粒DNA確切分子大小, 必須酶切線性化后,對比DNA分子量Marker才可以知道。處于環(huán)狀或者超螺旋狀態(tài)的的質(zhì)粒,泳動位置不確定,無法通過電泳知道其確切大小。
5、洗脫液EB不含有螯合劑EDTA,不影響下游酶切、連接等反應(yīng)。也可以使用水洗脫,但應(yīng)該確保pH大于7.5,pH過低影響洗脫效率。用水洗脫質(zhì)粒應(yīng)該保存在-20℃。質(zhì)粒DNA如果需要長期保存,可以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影響下游酶切反應(yīng),使用時可以適當稀釋。
關(guān)于平衡液BS的使用
介紹:核酸吸附硅膠膜柱子長期放置過程中會同空氣中的電荷/塵埃發(fā)生反應(yīng)而影響其核酸的結(jié)合能力。硅膠柱經(jīng)平衡液BS預處理后可大大減少柱子中硅膠膜的憎水基團,提高核酸的結(jié)合能力。從而提高硅膠柱子回收效率或者產(chǎn)量。平衡液BS是強堿性溶液,若不小心碰到,請用大量自來水清洗。用完后需蓋緊瓶蓋,以免接觸空氣。室溫保存。在保存過程中可能有沉淀生成,請加熱至37℃使沉淀完全消失。
使用方法:取一個新的硅膠膜吸附柱子裝在收集管CT中,吸取100μl的平衡液BS至柱子中。12000 rpm離心1分鐘,倒掉收集管CT中廢液,將吸附柱子重新放回收集管CT。此時平衡液BS預處理柱子完畢。接后續(xù)的操作步驟。
操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)
提示:
● 第一次使用前請先在漂洗液WB和去蛋白液PS瓶中加入指定量無水乙醇,充分混勻,加入后請及時在方框打鉤標記已加入乙醇,以免多次加入!
● 將RNase A全部加入溶液A中,混勻,每次使用后置于2-8℃保存。
1、取5-15 ml過夜培養(yǎng)的菌液,9,000rpm離心1-2分鐘,盡可能的倒干上清,收集菌體。
2、用500μl溶液A重懸菌體沉淀,渦旋振蕩至徹底懸浮,全部轉(zhuǎn)入一個2ml離心管。
如果有未徹底混勻的菌塊,會影響裂解,導致提取量和純度偏低。
3、加500μl的溶液B,溫和地上下翻轉(zhuǎn)6-8次使菌體充分裂解,室溫放置4分鐘。
溫和地混合,不要劇烈震蕩,以免基因組DNA剪切斷裂!所用時間不應(yīng)超過5分鐘!以免質(zhì)粒受到破壞。此時菌液應(yīng)變得清亮粘稠,如果菌體少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要準確的5分鐘。
4、加500μl溶液C,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn)6-8次,充分混勻時會出現(xiàn)白色絮狀沉淀。冰上靜置3-5分鐘,12,000rpm離心10分鐘,小心取上清。
5、加入溶液C后應(yīng)該立即混勻,以免產(chǎn)生SDS的局部沉淀。如果上清中還有微小白色沉淀,可再次離心后取上清。
平衡液BS預處理吸附柱:
使用平衡液BS預處理硅膠膜吸附柱為必做步驟,具體方法參見前文“關(guān)于平衡液BS的使用”
6、將上層水相中加入0.5體積異丙醇(約740ul)后充分顛倒混勻后分多次(每次不超過700ul)轉(zhuǎn)入吸附柱AC中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm離心1分鐘,倒掉收集管中的廢液。直到所有混合溶液通過此吸附柱。
7、加入500μl去蛋白液PS(請先檢查是否已加入無水乙醇?。?2,000rpm 離心30秒,棄廢液。
此步驟為了去除痕量核酸酶等雜質(zhì),如所用菌株為JM系列、HB101等endA菌株或野生型菌株,核酸酶含量豐富,應(yīng)加此步驟;如所用菌株為XL-1 Blue和DH5α等缺陷型菌株,核酸酶含量低,則可略過此步驟。
8、加入600μl漂洗液WB(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。
9、將吸附柱AD放回空收集管CT中,12,000rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng)。
10、取出吸附柱AD,放入一個干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加100μl-250洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水浴中加熱效果更好),室溫放置2-5分鐘,12,000rpm 離心1分鐘。如果需要較多量質(zhì)粒,可將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,離心1分鐘。
洗脫體積越大,洗脫效率越高。如果需要質(zhì)粒濃度較高,可以適當減少洗脫體積, 但是最小體積不應(yīng)少于100μl,體積過小降低質(zhì)粒洗脫效率,減少質(zhì)粒產(chǎn)量。